Llojet kryesore të Spirulinës përfshijnë Spirulina maxima dhe Spirulina platensis.
Spirulina maxima zakonisht ka ngjyrë gri-jeshile, me qeliza që variojnë nga 7 deri në 9 mikronë në gjerësi, më të shkurtra se gjerësia e tyre dhe distanca ndër-spirale prej 70 deri në 80 mikron. Maja e saj është pak e mprehtë, muret e saj tërthore nuk janë të shtrënguara dhe anët e saj janë të mbuluara me kokrriza.
Spirulina platensis është një varietet superior i spirulinës me një përmbajtje jashtëzakonisht të lartë të proteinave, të paktën 56%, dhe përmbajtjen më të lartë të fikocianinës. Vlera e tij ushqyese tejkalon shumë atë të Spirulina maxima dhe Spirulina me ujë të kripur.
